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Decodificare l’invecchiamento: svolta degli orologi epigenetici specifici per tipo cellulare

Capire perché persone della stessa età cronologica possano avere condizioni di salute molto diverse è da tempo una sfida per ricercatori. L’età biologica, che riflette lo stato fisiologico di una persona, offre una misura più precisa dell’invecchiamento rispetto all’età cronologica. Un recente studio intitolato Cell-type specific epigenetic clocks to quantify biological age at cell-type resolution introduce uno strumento innovativo per misurare l’età biologica a livello cellulare. Questo approccio, noto come orologi epigenetici specifici per tipo cellulare, apre nuove prospettive nello studio dell’invecchiamento e delle malattie legate all’età.

Orologi epigenetici: un limite di precisione

Gli orologi epigenetici stimano l’età biologica analizzando la metilazione del DNA, una modifica chimica che regola l’espressione genica. Sebbene siano stati rivoluzionari, questi orologi spesso utilizzano dati da tessuti misti, mescolando segnali provenienti da diversi tipi di cellule. Questo approccio non tiene conto delle differenze nel modo in cui le singole cellule invecchiano, limitando la capacità degli orologi di rilevare i cambiamenti specifici associati a determinate malattie.

Ad esempio, i cambiamenti nelle popolazioni di linfociti influenzano l’invecchiamento nel sangue, mentre le alterazioni nei neuroni e nelle cellule gliali influiscono sull’invecchiamento del cervello. Gli orologi tradizionali forniscono una visione generale dell’invecchiamento, che nasconde queste dinamiche specifiche. Questo limite impedisce ai ricercatori di comprendere quali cellule siano più coinvolte nelle malattie legate all’età o rispondano meglio ai trattamenti.

Un nuovo approccio all’invecchiamento

Lo studio presenta gli orologi epigenetici specifici per tipo cellulare, che misurano l’età biologica a livello cellulare. Questi strumenti separano due componenti dell’invecchiamento: quello intrinseco, guidato dai cambiamenti di metilazione del DNA all’interno delle cellule, e quello estrinseco, che riflette i cambiamenti nella composizione cellulare dei tessuti. I ricercatori hanno scoperto che l’invecchiamento estrinseco rappresenta il 39% della precisione di un orologio epigenetico nel sangue e il 12% nel cervello. Isolando queste componenti, i nuovi orologi offrono una comprensione più chiara dell’invecchiamento cellulare.

Esempi pratici: orologi per cervello e fegato

Lo studio ha applicato questi orologi a neuroni, cellule gliali ed epatociti (cellule del fegato), ottenendo risultati significativi. Gli orologi specifici per neuroni e glia hanno rivelato un’accelerazione dell’invecchiamento biologico nelle persone affette da Alzheimer. L’accelerazione più marcata è stata osservata nelle cellule gliali del lobo temporale, suggerendo che queste cellule svolgano un ruolo chiave nella progressione della malattia. Curiosamente, l’invecchiamento neuronale nell’Alzheimer è risultato dovuto a cambiamenti nella metilazione del DNA piuttosto che a variazioni nella composizione cellulare, fornendo nuovi spunti sul processo neurodegenerativo in questo tipo di patologia.

Nel tessuto epatico, l’orologio specifico per gli epatociti ha rilevato un’accelerazione dell’invecchiamento in condizioni come la steatosi epatica non alcolica (NAFLD) e l’obesità. A differenza degli orologi epatici tradizionali, l’orologio specifico per gli epatociti ha catturato cambiamenti cellulari sottili, dimostrando una sensibilità superiore. Questi risultati evidenziano il potenziale degli orologi specifici per tipo cellulare nel comprendere i meccanismi delle malattie e nell’orientare interventi mirati.

Figura 1. Quantificazione dell’invecchiamento intrinseco ed estrinseco. (A) Rappresentazione grafica di come l’accuratezza predittiva di un orologio epigenetico derivato da tessuti misti possa essere scomposta in termini di processi di invecchiamento intrinseco ed estrinseco, come mostrato. L’accuratezza, misurata tramite l’R² di un orologio che riflette il processo estrinseco, può essere stimata utilizzando la formula indicata, se è possibile stimare le accuratezze dell’orologio completo non aggiustato e di quello completamente aggiustato per l’eterogeneità dei tipi cellulari (CTH). Quest’ultimo riflette l’invecchiamento intrinseco dei singoli tipi cellulari. (B) Grafici a barre confrontano i valori di R² dell’orologio non aggiustato e quelli degli orologi aggiustati per 12 e 9 tipi di cellule immunitarie, in ciascuno degli 11 gruppi di coorti di sangue intero. Il pannello a destra mostra la media e la deviazione standard dei due rapporti indicati attraverso le 11 coorti. Questi rapporti misurano la frazione dell’accuratezza dell’orologio non aggiustato attribuibile all’invecchiamento intrinseco. (C) Dataset di metilazione del DNA cerebrale, dove l’orologio aggiustato è stato calibrato per 7 tipi di cellule cerebrali.
 

Scoperte molecolari e percorsi patologici

Gli orologi hanno anche fornito informazioni sui meccanismi molecolari dell’invecchiamento. Diversi siti di metilazione del DNA utilizzati negli orologi si sono sovrapposti a geni implicati in malattie neurodegenerative e patologie epatiche. Ad esempio, geni come SESN2 e TOMM40L, associati all’Alzheimer, sono stati collegati agli orologi specifici per neuroni e glia. Questa sovrapposizione suggerisce che gli orologi non solo misurano l’età biologica, ma catturano anche cambiamenti molecolari rilevanti per le malattie, rendendoli strumenti preziosi per la ricerca e lo sviluppo di terapie.

Implicazioni per la ricerca sull’invecchiamento

L’introduzione degli orologi epigenetici specifici per tipo cellulare rappresenta un cambiamento fondamentale nella ricerca sull’invecchiamento. Questi strumenti permettono agli scienziati di:

  • Rilevare precocemente le malattie: Identificando l’accelerazione dell’invecchiamento in specifici tipi di cellule, gli orologi possono fungere da indicatori precoci di condizioni come l’Alzheimer o le malattie epatiche.
  • Sviluppare terapie mirate: Comprendere quali cellule invecchiano più rapidamente consente di sviluppare trattamenti mirati alle popolazioni cellulari più vulnerabili.
  • Personalizzare la medicina: Interventi basati sul profilo di invecchiamento cellulare di un individuo potrebbero migliorare la salute e prolungare la longevità.

Conclusione

Gli orologi epigenetici specifici per tipo cellulare offrono una visione senza precedenti della biologia dell’invecchiamento. Misurando l’età biologica a livello cellulare, questi forniscono nuove informazioni su come diversi tipi di cellule contribuiscano all’invecchiamento e alle malattie legate all’età. Questa innovazione non solo avanza la nostra comprensione dell’invecchiamento, ma getta anche le basi per diagnosi precoci e interventi personalizzati, aprendo la strada a vite più lunghe e più sane.

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